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但是，罗利军强调，常规稻种子大多也是通过杂交育种选育的。自然界本身就存在杂交行为。罗利军转而介绍说，大家可以宽心的是，水稻常规种子远没有到“濒临灭绝”的地步。以现在中国的水稻种植面积来看，北方以种植常规稻为主，南方以种植杂交稻为主，但也有种常规稻的，“比如江苏、安徽就种了几千万亩。”
不仅如此，在南方，常规稻种植甚至有扩大的趋势。中国水稻研究所副所长李西明告诉记者，拿早稻来说，杂交稻和常规稻的产量相差不大，但常规稻吃口较好，因此近年来不少农民改种了常规稻。
另有专家指出，常规水稻在中国现在大约有46%的种植面积，达2亿多亩。我国每个省都设有种子战略储备库，储备的常规种子比例远远大于30%，足以应对李昌平担心的“天灾”，也就是说，农民不会“无处补种”。
利益驱动下杂交种子受偏爱
罗利军说，常规稻和杂交稻，两者“旗下”各有数百个品种，在产量、米质、抗病虫等性状上各不相同，仅仅以“杂交”或是“常规”来区分高低，有失偏颇，“我们只拿品种和品种比较，科研人员中不存在杂交稻优于常规稻的笼统看法。”
但是，李昌平信中提出的常规稻受忽视，甚至“被有意打压”的倾向恐怕是存在的。或者说，在市场的意义上，常规种子和杂交种子是“被对立”的。因为农民需要每年去种子公司购买杂交种子，而种子公司靠这个赚钱，在利益驱动下，有人对杂交稻种放大音量唱赞歌，而多数科研人员也在研制杂交种子，“高产”、“抗病虫”、“抗旱”……每年都有许多不同性状的新品种投放市场。杂交技术不仅应用于水稻，在玉米、油菜、蔬菜等作物上也广泛应用。
在市场上，杂交种子的价格远高于常规种子。
罗利军说，在经济利益面前，多数人投向杂交种子的怀抱也属正常；但仍有不少科学家在坚持研究常规稻种——在他们看来，常规稻是杂交稻的基础。
应当尽快研究“第二次绿色革命”
李昌平在信中提到，“杂交水稻的农药、化肥使用量大”，这一点得到了许多科学家的共鸣。尽管多数杂交水稻的产量确实高于常规水稻，但罗利军指出，某些常规稻品种在综合性状上并不输给杂交稻。
现在的种子研究确实滑进了一个误区——一味追求高产。产量增加，往往要加大水、化肥、农药的投入，许多人不算成本账，结果产量是提高了，但农民的收益如何？
在罗利军看来，中国的粮食安全主要是中低产田的粮食安全问题。在占稻作面积70%以上的中低产田的实际生产中，许多杂交水稻新品种难有用武之地。根据多年研究，我国水稻的平均亩产尚在420公斤左右徘徊。而为追求高产而过量使用化肥，已成了土地“不能承受之痛”，同时，我国淡水资源有限。他说，既然杂交水稻和常规水稻各有利弊，就应该摒弃人为的“门户之见”，因地制宜选种最合适的品种。
罗利军说的，正是第一次“绿色革命”的“后遗症”。上世纪中期，通过农业技术改进，粮食产量大幅度提高，人们将这次农业飞跃称为“绿色革命”，我国杂交水稻是其中的杰出代表。
华中农业大学生命科学技术学院院长、中国科学院院士张启发认为，第一次“绿色革命”的成果固然喜人，但副作用和隐患也不容忽视：化肥、农药的大量使用使土壤退化；高产谷物中矿物质和维生素含量减低甚至变得很低，能让人“吃饱”却不能“吃好”，长期以此为食物，会降低人体的抵抗力。
近年来，一些国家已改变一味追求高产的思想，开始反思土地和粮食的关系。张启发强调，结合中国国情研究让人们“吃好”的“第二次绿色革命”策略，已是刻不容缓。