6月19日，一份《中国青少年发展基金会等5家基金会就2008年度企业所得税汇算清缴延期进行的紧急请示》【中青基联（2009）1号】（以下简称《请示》），传真到《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》编辑部。
针对国家税务总局近期向基金会组织征收企业所得税的问题，包括中国青基会、中国扶贫基金会等在内的5家基金会联名上书，提出反对意见。
基金会
税金先缴后退或致捐赠人误解
上述《请示》直指近来颇受争议的基金会组织的“捐赠收入”是否应计入企业所得税的问题。
《请示》称：“近期，税务局各分管所正在进行2008年度企业所得税汇算清缴工作，要求我们5家基金会把捐赠收入并入应税所得计缴2008年度企业所得税，待非营利的资格认定下来以后再将相应税款予以返还。我们共同认为，此举是不妥的，如此操作将产生严重不良后果。”5家冠名基金会是：中国青少年发展基金会、中国扶贫基金会、中国儿童少年基金会、南都公益基金会和友成企业家扶贫基金会。
《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》报随即独家专访了中国青少年发展基金会秘书长涂猛。涂猛称：“按照相关法律规定，基金会所募集的资金不应缴税，因此有关部门向我们收税有违规之嫌。中国青少年基金会在2008年募集资金4亿元，除去5·12汶川赈灾等项目支出2亿，还剩2亿。国家税务总局按照（总收入－资助支出）×20%的企业所得税计算办法，要从基金会收走4000万元的企业所得税。”
据涂猛介绍，国家税务总局已分别通知了前述5家基金会，准备收取企业所得税。该5家基金会表示反对，并集体汇成《请示》书面材料，递交到财政部、国家税务总局和民政部，但尚未得到答复。
涂猛说，对于基金会组织而言，先缴税后退税是从来没有过的事。更为严重的是，此举将给基金会带来资助资金拨付的困难，给捐赠人乃至社会带来误解。
南都基金会秘书长徐永光在接受《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》专访时说，自2008年新《企业所得税法》实施以后，至今一年半过去了，所有的基金会（税前扣除）资格认定都没有得到核准。“这样对基金会的税收就要形成一笔糊涂账。”徐永光对此忧心忡忡。
据徐永光介绍，发达国家对基金会接受的捐款免予征税，捐赠资金形成的投资增值收入也免税；至于企业或私人给基金会的捐款，用基金会所开的发票可以抵税。而2008年南都集团给南都基金会捐赠了6400万现金，用于赈灾5·12汶川大地震项目，但基金会给南都集团开出的发票却失去作用，南都集团享受不到12%的抵税优惠政策。
国税总局
征税是临时措施
《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》记者试图从国家税务总局得到相关的解释，但所得税司综合处的官员说，对基金会（税前扣除）资格认定方案还没出来以前，上述基金会组织需要缴税。不过“这是临时措施，具体问题不能说”。
此外，国家税务总局相关负责人还表示，南都基金会不是资格认定单位。对此涂猛认为，中国青少年发展基金会与其他4家单位都是在民政部注册的国家级基金会，完全符合《基金会管理办法》的9条规定。徐永光也表示，南都基金会符合相关规定。
对于基金会组织的意见，民政部基金会管理处处长刘忠祥在接受《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》专访时说，对5家基金会捐赠收入是否课税，解释权在国家税务总局和财政部。
刘忠祥说，按照《基金会管理办法》条例规定，基金会早先享受两块优惠政策：一是捐赠收入，一是存款利息，均不收所得税。
但自2008年1月1日新《企业所得税法》出台以后，财政部发文规定，基金会原来所享受的优惠政策暂时停止、取消，同时等待新的政策出台。但直到目前，新的政策还没有出台，一些税务部门也开始向基金会征收相应税赋。
华夏文化纽带工程组委会执行委员会常委、中华社会文化发展基金会副秘书长蒋晔在接受《每日经济开云网页版-开云（中国）官方在线登录》采访时表示，2008年中国基金会行业发生了历史以来第一次 “井喷”现象，整个基金会行业募集资金1050亿元。蒋晔还认为，以基金会法人资质认定方案没有出台作为征税的理由之一，这一做法值得商榷。
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