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环境科技与标准
环境科技方面，2009年，本市围绕环境保护“十二五”规划编制、世博会环境质量保障、污染物总量控制、水源地水质安全保障、崇明生态岛建设和环境政策与立法工作等领域，开展了“上海市十二五环境保护规划前期研究暨2025远景规划”和相关专项规划研究，“2010年上海世博会空气质量保障措施研究”，“上海市污水处理厂氮、磷减排对策研究”，“淀山湖水文水质建模与水华预警初步研究
”，“崇明岛生态环境指标体系与监测网络优化研究”，“上海环保地方立法后评估指标体系研究”等环保科研工作。市环境科学研究院牵头完成的“城市景观水体生物净化关键技术研究与苏州河梦清园示范”课题获上海市科学技术进步一等奖，市环境监测中心牵头完成的“上海市水污染源在线监测系统及在线监测系列规范”和“上海市环境空气质量预测预报系统的建立及在高污染日预警联动中的应用”两项课题分获上海市科学技术进步二等奖。
环境标准方面，2009年，经市政府同意，市环保局和市质量技监局联合发布了修订的《上海市污水综合排放标准》（DB31/199-2009）。新标准自2009年10月1日起实施，同时代替原标准DB31/199-1997。
清洁生产方面，为贯彻落实《中华人民共和国清洁生产促进法》，根据环境保护部《关于进一步加强重点企业清洁生产审核工作的通知》（环发〔2008〕60号）要求，市环保局、市经济信息化委联合发布了本市2009年度重点企业清洁生产审核名单，共计55家，其中市级重点监管企业11家。除部分“双有”（有毒、有害）、“双超”（超总量、超标准）企业外，还涉及化工、制药、印染、电镀等重污染行业的企业，以及二氧化硫和化学需氧量减排的重点污染源企业。
意见提案办理
2009年，市环保局共收到人大书面意见、政协提案51件。其中，人大书面意见17件，主办件3件、合办件3件、会办件11件；政协提案34件，主办件8件、合办件5件、会办件21 件。现场办理接待代表、委员口头咨询10件，全部当场给予代表答复。所有书面意见、提案全部按时、按质完成办理任务，办理率、满意率均为100％。
投诉受理
2009年，全市环保系统共受理环境污染投诉27486件，其中，来信1999件/18810人次，办结率为97.1％；来电21973件，办结率为99.5％；来访797批/2256人次，办结率为98.0％，电子邮件2717件，办结率为99.2％。
根据投诉内容分类：水污染投诉2172件，大气污染投诉8884件，噪声污染投诉11490 件，固废污染投诉184件，放射性污染投诉13件，电磁辐射投诉240件，油烟气污染投诉 2391件，危险化学品投诉30件，农业化肥污染投诉59件，畜禽养殖污染投诉92件，新建项目投诉249件，环境监测投诉9件，政风行风投诉33件，其他投诉1640件，分别占环境污染投诉总量的7.9％，32.3％，41.8％，0.7％，0.04％，0.9％，8.7％，0.2％，0.2％， 0.3％，0.9％，0.03％，0.19％和6.0％。
公众参与
2009年全市围绕“绿色世博”、“污染减排”、全面推进环保三年行动计划等内容，开展了一系列宣传活动。
2009年世界环境日宣传活动以上海“迎世博，创建国家环保模范城市”为主线，结合2009年世界环境日的中国主题“减少污染 行动起来”，联合国环境署主题“地球需要你，团结起来应对气候变化”展开，全市18个区县举办了形式多样的宣传活动。
中华环保世纪行（上海）宣传活动围绕“迎世博，让环境更美好”主题，组织记者进行了集中采访，开展了2008年上海市中华环保世纪行宣传活动好开云网页版-开云（中国）官方在线登录评选工作。
开展了首批上海市绿色社区的推荐、评审和命名活动，新家园、裕华小区等 18个社区被命名为“上海市绿色社区”。