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北京生命科学研究所柴继杰研究员在《2008科学发展报告》上撰写了“细菌效应蛋白AvrPto激活植物免疫的结构基础”一文，简单介绍了柴继杰博士实验室的最新成果，该成果发表于2007年9月13日的《自然》（Nature）上。

植物被病原微生物侵染时，会产生抵抗能力，其中包含与抵抗发病有关的蛋白质，Pto就是番茄中的抗性蛋白，AvrPto是丁香假单胞杆菌中发病相关的效应蛋白。AvrPto在易感宿主内，能通过抑制PAMP引发的免疫信号通路的早期步骤，MAPK3的上游，发挥其毒性功能。AvrPto进入含有Pto和Prf的抗性植物体内，被植物体内的抗病蛋白精确识别，而激活植物的抗病反应，表现为超敏反应，产生局部的细胞凋亡，从而限制病原菌的进一步传播。AvrPto在两种不同的宿主，会产生完全不同的功能。

为解释AvrPto与Pto相互作用引发疾病抗性的机制，柴继杰实验室运用蛋白质晶体学、生物化学和遗传学的方法，研究了番茄中的抗病蛋白Pto与丁香假单胞杆菌中的致病蛋白AvrPto的复合物，获得了AvrPto-Pto的晶体结构。基于该结构和相关实验结果，提出了AvrPto通过解除Pto对防御响应的抑制引发疾病抗性的机制，提示了Pto进化来模拟AvrPto的毒性目标。

这一研究从分子水平上揭示了细菌致病蛋白AvrPto激活植物免疫系统的结构基础，对深入探讨植物如何识别病原菌的致病蛋白、启动防御反应、限制病原菌繁殖的复杂抗病机制以及设计小分子的植物抗病的药物、病原菌与宿主的协同进化的认识有重要意义。（摘自中国科学院“科学发展报告”课题组撰写的《2008科学发展报告》）