中日两国自八十年代以来在人口和计划生育领域开始合作。近年来，两国在人口和计划生育领域的合作不断取得积极进展，在综合扶贫、健康促进、人员交流和能力建设、公民社会组织发展等多个社会发展领域建立了政府间合作。

2004年7月，中日双方政府换文确认实施日本政府无偿援助“中国生殖健康家庭保健培训中心器材完善计划”项目，为在江苏太仓建立中国生殖健康家庭保健培训中心（简称CTC）提供了约为3亿日元医疗、培训设备的无偿援助。目前该中心已开始有效运作，已为来自45个国家的部长和高官进行了培训，为全球的人口与发展事业开展了积极的工作。

中日政府间还启动了 “加强中国中西部地区生殖健康/家庭保健服务能力建设”项目，旨在促进中西部地区现有计划生育服务机构的生殖健康家庭保健服务能力建设，以进一步为农村居民提供更多的与生殖健康家庭保健相关的公共服务。

在贵州省开展的中日合作“全民参与综合扶贫试点项目”已进入第二周期（2005年-2009年），该项目将在家庭保健、综合扶贫、生态农业、村民自治四个领域开展活动，总结推广健康促进为重点的综合扶贫模式，促进村民自治与非政府组织发展，促进村民和外出务工人员生活技能改善，提高公共管理和公共服务水平。