这份审计报告中，还对4个直辖市和41个大中城市的住房公积金进行了审计调查。审计部门发现，中高收入群体从公积金中受益更大，而低收入群体的居住条件却没有因此改善。

国家审计署审计长李金华说：“公积金的使用更多地惠及了中高收入群体，对低收入群体改善居住条件的倾斜力度不够，未能有效发挥住房公积金在改善低收入职工居住条件方面的作用。”

审计报告在对1986万人的缴存情况统计后发现，其中10%缴纳较多公积金的人，每个月交1572元，10%较少的人只有54元。而32个城市住房公积金贷款发放和公积金提取情况显示，2005年住房公积金个人贷款的44.9%发放给了排在缴存额前20%的高收入人员，排在缴存额后20%的低收入人员仅得到3.7%的贷款。有些地区，一些经济效益好的单位，甚至还把多报基数、多缴住房公积金作为为职工谋利和逃税的手段。