国际微生物大数据平台的应用与启示

全面参与国际微生物数据标准制定

长期以来，由于各个微生物资源中心采用不同的数据格式进行数据管理和共享，这极大地阻碍了微生物数据交换和在全球范围共享资源的效率。中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心和 WDCM 基于其组织的全球微生物菌种目录（GCM）微生物数据资源国际合作计划的工作基础，并经过与国际标准化组织生物技术委员会（ISO/TC 276）及 WDCM 各国专家的讨论逐渐形成了《微生物资源中心数据管理和数据发布标准（草案）》。经过一年多的筹备，2017 年 7 月，作为 ISO/TC276 生物样本库与生物资源工作组（WG2）和生物数据处理及整合工作组（WG5）的共同项目，该项目通过了 ISO 的新工作项目提案（new work item proposal）投票正式立项。该项目现已注册为工作草案（working draft），预计将在 2 年内正式发布国际标准，并将成为微生物资源数据领域的第一个 ISO 国际标准。该标准的制定和实施将有助于保证微生物资源数据质量，并提高全球范围微生物数据的兼容性和互操作性，为高效的数据共享和大数据分析提供基础。

为《名古屋议定书》及履约工作在微生物领域的实施提供重要支撑

我国幅员辽阔，是全球 12 个生物多样性大国之一，遗传资源极其丰富。但长期以来，我国一直是发达国家获取遗传资源和遗传资源相关传统知识的主要对象，外国机构和个人通过多种非正当手段大量获取我国丰富的生物遗传资源，由此造成的流失数量和价值难以估量，形势十分严峻。

《生物多样性公约》（Convention on Biological Diversity，CBD）旨在保护濒临灭绝的植物和动物，最大限度地保护地球上的多种多样的生物资源，以造福于当代和子孙后代。我国于 1992 年 6 月11日签署该公约，1992 年11月7日批准，1993 年1月5日交存加入书。2010年10月，联合国《生物多样性条约》第 10 届缔约方大会（简称“COP10”）通过《名古屋议定书》（The Nagoya Protocol，NP）；2014 年10月，《名古屋议定书》正式生效。《名古屋议定书》规定通过适当的资金援助和技术合作来保护生物多样性，实现生物遗传资源的可持续利用，其目的在于保障生物遗传资源利益的公平分配。

WDCM 大数据平台下的“全球微生物菌种目录系统”（GCM）是一个包含微生物资源的检索、分析和可视化的综合数据库。GCM 结合更多的在线目录数据，将菌种资源与核酸序列、蛋白质、参考文献、引文数据等进行关联，并以统一数据门户的形式，对全世界科技界和产业界提供微生物菌种资源的信息服务。GCM 对于微生物实物资源从采集、保藏、跨国转移、学术和商业应用以及利益分享的各个环节都能提供有效的数据支持，为《生物多样性公约》及《名古屋议定书》（CBD/NP）在微生物领域的实施和执行提供最重要的支撑。GCM 平台及其相关的指导原则，在国际上第一次建成一套完善的可运行的信息平台方案。WDCM 在 CBD/NP 实施方面的相关工作，也符合我国参与 CBD 工作的主要方向。目前，CBD 的信息交换所、国际微生物领域、法律界以及我国环保部专家都对 WDCM 的相关工作给予了高度认可，对 GCM 平台对 CBD/NP 的实施给予了相当的肯定。