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第三章 项目申报与批复
第八条 水利部负责组织编制中央分成水资源费项目规划，建立项目库。
第九条 中央分成水资源费年度实施项目由水利部根据中央分成水资源费项目规划，结合水资源节约、保护和管理工作需要确定。
第十条 中央本级年度实施项目由水利部、新疆生产建设兵团按照部门预算管理程序分别组织申报、实施。
地方年度实施项目由水利部商财政部于每年3月底前下达预算控制数；省级水利、财政部门组织编制项目实施方案，每年4月30日前联合向水利部、财政部申报；水利部负责组织对地方项目实施方案进行审核，报财政部审定。省级水利、财政部门对申报材料的真实性、合规性负责。
第十一条 省级水利部门根据下达的项目与资金，负责组织项目实施。
第十二条 项目资金支付按照财政国库管理制度的有关规定执行。
第四章 资金监督与检查验收
第十三条 各级财政、水利部门及项目承担单位应当严格执行国家有关资金使用管理规定，切实做到专款专用，严禁截留、滞留、转移、挪用资金和随意调整预算。属于政府采购范围的，应当按照政府采购制度的有关规定执行。
第十四条 各级财政、水利部门要按照现行法律法规及预算和财务管理制度加强对中央分成水资源费的使用管理和监督检查。
第十五条 水利部负责组织对重点项目进行验收和绩效评价。验收和绩效评价结果作为项目申报、选择承担单位及确定预算额度的重要依据。
省级财政、水利部门负责组织本行政区域内地方项目的验收和绩效评价，并将验收和绩效评价结果报财政部、水利部。
第十六条 对中央分成水资源费使用管理过程中存在财政违法行为的单位及个人，依照《财政违法行为处罚处分条例》（国务院令第427号）及有关法律、法规给予处理、处罚、处分。
第五章 附 则
第十七条 本办法由财政部、水利部负责解释。
第十八条 本办法自2011年3月30日起施行。